
折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
11 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
Time (days)
OA
0
0942
0846
0691
0515
4
0717
0836
0653
0483
24
0408
0367
0342
0231
48
0451
0409
0335
0196
打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图
在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧
12 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
Time (days)
Control Treated
0
0717
0942
0691
0303
0942
0846
0691
0515
4
0836
0527
0988
0321
0717
0836
0653
0483
24
0653
0401
0691
0169
0408
0367
0342
0231
48
0483
0342
0776
0917
0451
0409
0335
0196
打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,
仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
在Data栏中输入数据
软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后
13 用已经处理好的1组数据做折线图
如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
Table3
Time (days) OA
Mean SD
0
1000
017
4
1725
021
24
2133
041
48
1859
056
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,
在data栏中粘贴数据,
打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了
14 用已经处理好的2组数据做折线比较图
如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和13的一样。
Time (days) Control Treated
Mean SD Mean SD
0
1000
017
3604
031
4
1725
021
2534
043
24
2133
041
3381
074
48
1859
056
3913
093
仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,
将数据粘贴进去
软件即时生成的图
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
2 柱状图
柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
21根据Table 5的原始数据做柱状图
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0942
0717
Sample2
0846
0836
Sample3
0691
0653
Sample4
0515
0483
选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD),
在Data分栏中输入以下数据
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,
22 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
Table 6
Group A Group B
Control
0942
0846
0691
0515
,
0717
0836
0653
0483
Treated
0408
0367
0342
0231
0451
0409
0335
0196
这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图。
在Data分栏中输入以下数据
软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,
23如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
Table 7
Control
Mean
SD
A
1000
017
B
1725
021
C
2133
041
D
1859
056
仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,
软件及时生成柱状图,如下图
24 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
Control Treated
A
1000
017
3604
031
B
1725
021
2534
043
C
2133
041
3381
074
D
1859
056
3913
093
*** 作步骤和23一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,
在data栏中输入数据
软件即时生成的图
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律
一. 折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二. 柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
3 组合和导出
点击layout栏,出现下图所示界面
根据你的的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
将做好的拖到对应的方格中,用添加文章工具加入编号,
然后导出
点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度
点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了方法步骤:
第一步:百度搜索进入“亿图在线”,点击“开始作图”按钮。
第二步:新建散点图。依次点击“图表”-“散点图”。然后从例子库中,选择一个模板,点击打开散点图模板。
第三步:先点击画布中的散点图,再点击右侧属性面板中的数据符号,最后点击“图表数据”,通过修改表格中的数据,即可改变画布中散点图的数据。当然,也可以直接导入excel或csv数据文件,一键生成散点图。
第四步:双击文本框,替换散点图模板里的文字。
第五步:完成散点图的绘制后,可以点击右上角的保存、下载、打印、分享等按钮,对绘制好的散点作品进行存储。也可以将作品导出为、PDF、PPT等格式。1、散点图的作法与其它图表的作法不同的一点是:不要选择标题行或列,仅选择数据项,如下图中标绿色的部分,并插入散点图,系统自动生成图2的图表。
2、删除图表中不需要的网格线,和图例,这样会显得清爽一些。
3、分别设置X-Y坐标轴格式,将X坐标轴交叉位置设置为20,标签选择:低,将Y轴交叉位置设置为30,标签选择:低,通过以上设置,X-Y坐标标答均位于最下边和最左边,X-Y2轴相互交叉,组成一个四象限图。
4、只所以生成这样,是因为前面已设置了X-Y轴交叉的位置分别为30-20,而非默认的0-0,为了正确显示,此时可以再将此值更改为默认值即可。
有的时候我们用ggplot2画了图,比如说散点图,那么如何在一堆点里标出我们关注的点呢?
比如:我想把后两列用散点图表示出来,那么:
如果想改变点的形状,这里是数字对应的形状: ggplot2 point shapes
觉得图的背景灰色格子很难看吗?可以去掉:
图画的差不多了,但是我想在图里标注一个特定的点:
给特定点添加注释:
NOTE: 如果你添加了很多个特定点,而这些点离的很近,注释信息重叠了,你可以通过改变注释信息的位置来调整。调整注释信息位置的参数是hjust和vjust
hjust: 调整左右位置。 以红点为中心,该数值越大,注释信息越靠左,05时在中间
vjust: 调整上下位置。以红点为中心,该数值越大,注释信息越靠下,05时在中间
比如现在,基因名在红点的右侧偏下,我想把它调整到红点的左上方,那么:
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