农村合作医疗办理流程如下：
1、各社区以户为单位进行审核、登记，并进行微机录入，打印出参保人员名单，并收缴费用；
2、街道劳动保障综合服务中心对全处参保情况进行汇总；
3、街道办事处上报区新型农村合作医疗办公室参保情况；
4、组织各社区携带打印出的参保人员名单然后发放到参保人员手中。
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法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二条
国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
第三条
社会保险制度坚持广覆盖、保基本、多层次、可持续的方针，社会保险水平应当与经济社会发展水平相适应。
农村合作医疗办理需要什么证件
2、农村居民的身份证原件以及复印件；
3、若是为小孩办理，并且小孩是初次办理的，需要提供小提供本人有效的出生证明复印件；
4、申请者准备本人近期免冠一寸相片一张。
5月19日市医疗保障局回复如下：您好!个人缴纳的医疗保险有个体灵活就业医保和城乡居民医保。
符合个体灵活就业医保参保条件的，需携带本人工商银行卡复印件、二寸白底免冠彩照2张市区户籍提供户口本主页和本人页复印件及身份证原件、市区外户籍提供居住证原件及复印件，到户口或居住地所在社区居委会办理新参保业务。
参加城乡居民医保，需携带户口本或居住证的原件和复印件到居住地所在社区、乡镇、村屯办理参保。
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